沉积学报于1981年5月8日由中国科学院批准创刊，1983年3月正式出版了创刊号。 内容涉及面广，包括沉积学、沉积矿产、地球化学以及相关分支学科、交叉学科的基础和应用基础研究的成果、沉积学研究的新方法、新理论的介绍等等。学报始终坚持贯彻“双百”方针，紧密结合国民经济建设的需要，及时报道国内外沉积学方面的新成果、新方法、新技术，坚持开展学术交流、促进沉积学发展的办刊宗旨。本刊发表的论文有相当一部分代表了当时国内外沉积学研究的最高水平和最新成果，为了从内容和形式上与国际接轨，1997年沉积学报改为210mm×297mm的大16开本，刊载容量有了大幅度提高。由过去年刊发50～60篇论文提高到目前的120篇。
据中国科技信息研究所万方数据公司1999年统计分析结果，本刊基金论文数所占比例为47%，较1991～1995年的27%，有很大提高。作者分布地区遍布全国17个省、市、自治区。1991～1995年统计表明，高校作者约占30%～35%，中科院占30%其他产业部门约占35%。近几年来，由于行业调整等因素的影响，高校作者的比例有所上升，可达50%，产业部门的比例则有所下降。90年代起，中青年作者逐渐居主导地位。截止目前，45岁以下的作者占60%～80%，从最新统计结果看，45岁以下作者占84%。
沉积学报的编校质量近两年来也有了明显改善。1998年甘肃省正式报刊编校质量抽查差错统计，沉积学报差错率为2.51/万，高于新闻出版署要求的3/万的标准。2005年，中国科学院期刊中心对我刊样本的质量抽查结果表明，《沉积学报》刊登的重点论文（即基金及国家攻关项目）可达85％，编校质量及印刷质量均达到良好标准。

 

沉积学报的学术水平也得到了期刊机构的肯定。目前，沉积学报是我国沉积学界唯一一本核心期刊。1989年及1992年，沉积学报被评为甘肃省优秀期刊；1990～1991年中国自然科学核心期刊100种 中，沉积学报入选，排名第64位；1992～1993年中国自然科学核心期刊300名中，沉积学报排名第53位；由北京高校图书馆期刊工作研究、北京大学图书馆共同发起研究、编辑和出版的《中文核心期刊要目总览》中，沉积学报分别在石油、天然气工业期刊和地质学类期刊中列为核心期刊；1994～至今，沉积学报被列为中国学术期刊综合评价数据库来源期刊、中国科学引文数据库来源期刊、中国期刊网及中国学术期刊（光盘版）全文收录，日本科技文献速报数据库收录期刊。目前，《沉积学报》作为核心期刊继续被联合国《水科学和渔业文摘》（Aquatic Sciences and Fisheries Abstracts, ASFA）所收录。自2000年以来，《沉积学报》的影响因子连续3年稳步续增长：据中国科技信息研究所期刊引证报告1998年沉积学报影响因子为0.176，被引频次为218次；1999年影响因子为0.246，总被引频次为294次； 2001年11月统计资料，《沉积学报》2000年期刊影响因子为0.376,总被引频次为324次，在地质地理类期刊中居第7位，在1400多种统计源期刊中居第225位。据中国科技信息研究所2002年10月统计资料，《沉积学报》2001年期刊总被引频次为480次，影响因子为0.463,在1400多种统计源期刊中居第217位。据2003年10月中国科技信息研究所发布的“中国科技期刊引证报告”，《沉积学报》的总被引频次为622次，影响因子为0.751，在1534种科技期刊影响因子总排序中列87位，据2004年报告，沉积学报被引频次851次，在地质科学类期刊（30种）中排名第5，影响因子为0.804，学科内排名第11名。2004年沉积学报被引频次1228次，影响因子1.004.2005年沉积学报被引频次1447次，影响因子0.927。